S hledáním léku proti koronaviru pomáhá brněnským vědcům umělá inteligence

„Jsme u počítače, na kterém máme spuštěný program Caver Dock. A teď tam zadáváme výpočet, který se nám za chvilku spustí,“ říká výzkumník Jiří Damborský v malé laboratoři na Přírodovědecké fakultě. Na obrazovce se rýsuje animace proteinu, který je zodpovědný za šíření koronaviru v lidském těle. Právě tuhle nepatrnou bílkovinu se vědci rozhodli prozkoumat podrobněji. Cílem bylo zjistit, zda některé doposud schválené léky mohou funkci proteinu zablokovat, a tím pádem zabránit navázání viru na lidské buňky.

„My jsme vzali všechny léky, které jsou celosvětově schválené. Jsou to léčiva, která prošla přes schvalovací procedury a využívají se k léčbě různých onemocnění, které nemusí s virovým onemocněním mít vůbec nic společného.“

Software vs člověk

K testování účinnosti jednotlivých léků na daný protein využili vědci speciální software, který si na univerzitě sami vyvíjejí. Právě zapojení umělé inteligence výzkumníkům práci výrazně zjednodušilo, jak vysvětluje jeden z autorů programu Jiří Filipovič z Ústavu výpočetní techniky. „I to, co dělá ten náš software Caver Dock, by teoreticky šlo počítat s mnohem primitivnějším nástrojem a využitím lidské síly, ale to, co nám ten software spočítá za deset minut, to by třeba expert dělal půl roku. Takže tam jde hlavně o to, že si můžeme dovolit mnohem masivnější analýzy dat.“

Testování v laboratoři

První výsledky zatím ukazují, že mezi testovanými vzorky existuje několik léků, které by na covidovou infekci mohly zabírat. Vybrané molekuly teď ale vědci budou muset ještě experimentálně prověřit v laboratoři.

„Experimentální testování se nejprve bude dělat na takzvané in vitro úrovni, takže na úrovni toho proteinu. Potom se půjde na in vivo úroveň, to se bude testovat na buňkách. A pak už by se mohlo jít do procedur schvalovacích. Takže se může relativně rychle dostat ta molekula do fáze schválení jako potenciální léčivo na to covidové onemocnění.“

Nový lék?

Za jak dlouho by případně mohl vzniknout zcela nový lék, ale zatím vědci netuší. Doufají však, že celý proces nebude trvat déle než několik měsíců.

„My vlastně už máme zkušenost celosvětově, kdy například Remdesvir byl schválen poměrně rychle pro použití pro covidovou infekci. A to byl lék, který byl původně vyvinut pro jiný účel, ukázalo se, že je efektivní pro dané onemocnění a ve schváleném režimu jsme se dostali na časový horizont kratší než jeden rok,“ uzavírá Damborský.

Kromě vědců z Masarykovy univerzity se na projektu podílejí také odborníci z Mezinárodního centra klinického výzkumu Fakultní nemocnice u svaté Anny v Brně.